Blaster: uma ferramenta de bioinformática

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Resumo

Em função do considerável aumento no número de sequências de nucleotídeos obtidas, oriundas dados diversos sequenciamentos gênicos seja de DNA ou RNA e das pesquisas buscando identificação da função de cada gene, faz-se necessário a utilização de softwares que auxiliam os pesquisadores na busca por sequências já conhecidas. Este estudo tem como objetivo o desenvolvimento de uma ferramenta on-line que agregue os softwares utilizados para análise de de DNA, RNA e proteínas, retornando ao pesquisador com o auxílio de apenas uma ferramenta, as sequências já conhecidas e armazenadas nas bases de dados do NCBI. Também tem a finalidade de identificar a função das proteínas analisadas, artigos e textos relacionados. Esta ferramenta integra os serviços dispersos de dois locais diferentes, o Servidor do NCBI e o Servidor do UniProt. Os resultados obtidos com as pesquisas de nucleotídeos e aminoácidos com a ferramenta desenvolvida, são idênticos aos obtidos acessando o site do NCBI e também retorna a função das proteínas e dados referentes aos artigos e textos relacionados a pesquisa, provindas do servidor do UniProt. O software desenvolvido conta com um sistema automatizado, o qual é executado com os dados inseridos pelo usuário e os resultados são compilados em um único arquivo no formato PDF, facilitando assim futuras pesquisas.

Descrição

Due to be significant increase in the number of nucleotide sequences, originating from several genetic seuqencers, be it DNA or RNA and the search for function identification of each gene, it in necessary to use auxiliary research software or search for sequences already carried out. This study aims to develop an online tool that aggregates the software used to analyze DNA, RNA and protein sequences, returning to the researcher or the help of just one tool, such as sequences already stored and stored in the databases NCBI data. It also has the possibility to identify the functions of proteins, articles and related texts. This tool integrates the services dispersed in teo diffent locations, the NCBI Server and the UniProt Server. The results with searches for nucleotides and amino acids with a developed tool, are accessible to access the NCBI website and also retum a function of the built proteins related to articles and texts related to a research, proved by the server of UniProt. The developed software contains an automated system, or the data entered by the user is executed and the results are compiled in a single PDF file format, thus facilitating searches.

Palavras-chave

Bioinformática, Aminoácidos, DNA - Análises, RNA, Sequenciamento de nucleotídeo

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