Identificação e caracterização fenotípica e molecular de bactérias isoladas de biofertilizantes líquidos de dejetos suínos

Abstract

O uso de antimicrobianos na pecuária é indispensável para a melhoria da qualidade das culturas animais, uma vez que são empregados na profilaxia, tratamento e promoção do crescimento animal. No entanto, esse uso contínuo tem contribuído para o surgimento de bactérias multirresistentes a antimicrobianos. Desse modo, neste estudo, visou-se isolar, identificar e caracterizar o perfil de resistência aos antimicrobianos e potencial patogênico de bactérias encontradas em biofertilizantes líquidos, provenientes de sistemas de biodigestão anaeróbios, alimentados por dejetos de suínos, por meio de técnicas fenotípicas e moleculares. As 125 bactérias identificadas, foram isoladas das amostras de biofertilizantes por spread plate, e identificadas por Matrix-Assistant Laser Dessorption Ionization Time-of-Flight (MALDI TOF), e submetidas ao teste de susceptibilidade aos antimicrobianos, conforme as recomendações do Clinical & Laboratory Standards Institute (CLSI) e do European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST), enquanto os genes de resistência e virulência foram pesquisados por Polimerase Chain Reaction (PCR). A similaridade genética entre os isolados de Escherichia coli foi investigada por Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus-PCR (ERIC-PCR). Foram identificadas duas grandes famílias bacterianas, Enterobacteriaceae (n=31) dos quais 90% eram Escherichia coli e nas Enterococcaceae (n=66) 44% eram Enterococcus hirae, sendo que 100% os isolados bacterianos (n=95) foram classificados como multirresistentes (MDR), além disso 15% dos Enterococcus foram resistentes à vancomicina (ERV). A técnica de ERIC-PCR demonstrou uma heterogeneidade na diversidade genética entre os isolados de E. coli, apresentando, de forma geral, 47% de similaridade genética entre si. Nas Enterobacteriaceae foi detectado o gene ecpA em mais 83% dos isolados e outros doze genes de virulência foram encontrados, enquanto nos Enterococcus foram encontrados 8 genes de virulência ace, efa, esp, gls-like-24, psaA, cbh, gelE, cpsEnd/cpsG. Com este estudo, foi possível traçar um perfil fenotípico, molecular dos isolados bacterianos, mostrando a presença de cepas multirresistentes a antimicrobianos, após a biodigestão anaeróbia. Isso sugere que o uso intensivo de antimicrobianos na produção animal pode contribuir para surgimento de bactérias multirresistentes que podem estar sendo dispersas no ambiente por intermédio dos biofertilizantes produzidos com dejetos suínos. Portanto, procedimentos de vigilância e busca de dados, como este, são importantes formas de contribuir para um melhor entendimento da disseminação de bactérias sobreviventes a processos de biodigestão, possibilitando traçar estratégias de prevenção e mitigação de potenciais patógenos resistentes aos antimicrobianos, que são dos maiores desafios para a saúde pública mundial.